Scienza

La contaminazione del laboratorio è probabilmente responsabile del “Deltacron”, affermano gli scienziati

È probabile che un apparente ceppo di coronavirus che combina mutazioni delle varianti Omicron e Delta sia il risultato di una contaminazione di laboratorio, hanno affermato gli scienziati.

Durante il fine settimana sono emersi timori che un nuovo ceppo di Covid, soprannominato “Deltacron”, fosse emerso da un cosiddetto evento di ricombinazione, quando due varianti co-infettano un paziente e si scambiano mutazioni per produrre una nuova progenie virale.

Finora sono state segnalate venticinque sequenze di Deltacron, ma gli esperti hanno insistito sul fatto che non ci sono prove che suggeriscano che Omicron e Delta si siano combinati per generare una nuova variante.

“Questo non è quasi certamente un ricombinante biologico dei lignaggi Delta e Omicron”, ha affermato il dottor Jeffrey Barrett, direttore della Covid-19 Genomics Initiative presso il Wellcome Sanger Institute.

Invece, è stato suggerito che frammenti di Omicron siano stati accidentalmente inseriti nel patrimonio genetico di Delta durante il processo di sequenziamento che avviene quando si tenta di identificare un’infezione variante Covid.

Questo è un errore comune che può verificarsi in qualsiasi laboratorio, ha affermato Aris Katzourakis, professore di evoluzione e genomica all’Università di Oxford.

Ha spiegato che, durante il sequenziamento di un virus, il suo genoma viene diviso in frammenti genetici e quindi analizzato prima di essere riassemblato in un computer.

Tuttavia, un particolare frammento di Delta tende a “cadere” durante il processo di sequenziamento ed è “sensibile alla contaminazione”. Nel caso dei 25 campioni “Deltacon”, sembra che questa particolare lacuna sia stata colmata da un frammento di Omicron, ha affermato il professor Katzourakis.

“Questo è un segno rivelatore di contaminazione del laboratorio che dà l’impressione di ricombinazione”.

Il dottor Barrett ha affermato che le mutazioni di Deltacron che sembravano derivare da Omicron erano localizzate “precisamente ed esclusivamente” nel frammento del genoma Delta che è “influenzato da un artefatto tecnologico in alcune procedure di sequenziamento”.

I 25 campioni segnalati a Gisaid, un database di varianti globale, sono stati elaborati in più procedure di sequenziamento in più di un paese, secondo Leondios Kostrikis, professore di scienze biologiche presso l’Università di Cipro che per primo ha identificato Deltacron.

“Questi risultati confutano le affermazioni non documentate secondo cui Deltacron è il risultato di un errore tecnico”, ha affermato il professor Kostrikis.

Tuttavia, il professor Katzourakis ha affermato che il processo di combinazione accidentale di frammenti di varianti durante il sequenziamento di molti campioni di Covid in un laboratorio è stato “un errore comune”. “Succede sempre”, ha aggiunto.

“Non è impossibile che avvenga la ricombinazione tra le varianti. Solo, questa non ne è una prova.

“Se si trattasse di un vero evento di ricombinazione, quando si crea un albero di sequenze Delta e Deltracron, le sequenze Deltacon dovrebbero formare un ramo distinto in quell’albero, indicativo della loro discendenza comune.

“Quello che vedi invece è un mix delle sequenze Deltacron all’interno dell’albero del Delta. Ciò significa che non formano un lignaggio distinto”.

Indipendentemente da come è stato, gli esperti e i funzionari non sono interessati da Deltacron.

“Non è uno di cui preoccuparsi”, ha affermato il professor David Matthews, virologo dell’Università di Bristol.

Il ministro della salute cipriota Michael Hadjipantela ha dichiarato domenica che Deltacron non è preoccupante e che maggiori dettagli saranno forniti in una conferenza stampa nel corso della settimana.

Il professor Lawrence Young, virologo della Warwick University, ha affermato che l’attenzione della più ampia comunità scientifica deve essere su come “gestiamo l’inevitabile emergenza di nuove varianti e su come queste vengono convalidate e riportate.

“Le varianti continueranno a comparire finché il virus continuerà a diffondersi nelle regioni poco vaccinate. Ecco perché la vaccinazione globale è così importante”.

Fonte: independent.co.uk

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